Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMC4Q7Z404 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMC4Q7Z404 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms