Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf139Q6ZV77 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf139Q6ZV77 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms