Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms