Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
KCNIP4Q6PIL6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms