Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
KLHL35Q6PF15 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
KLHL35Q6PF15 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms