Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf53Q5VUE5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf53Q5VUE5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms