Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
STRIP1Q5VSL9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STRIP1Q5VSL9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms