Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAPPC3LQ5T215 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAPPC3LQ5T215 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms