Protein–RNA interactions for Protein: Q32NC0

C18orf21, UPF0711 protein C18orf21, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf21Q32NC0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
C18orf21Q32NC0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C18orf21Q32NC0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms