Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SGSM1Q2NKQ1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SGSM1Q2NKQ1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms