Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SWI5Q1ZZU3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SWI5Q1ZZU3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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