Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITSN1Q15811 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITSN1Q15811 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITSN1Q15811 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
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