Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SF3A2Q15428 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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