Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPAQ15257 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PTPAQ15257 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms