Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL9A2Q14055 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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COL9A2Q14055 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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COL9A2Q14055 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COL9A2Q14055 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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COL9A2Q14055 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COL9A2Q14055 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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