Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKRN4PQ13434 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKRN4PQ13434 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
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