Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IKZF1Q13422 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms