Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTK7Q13308 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTK7Q13308 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms