Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP4Q13115 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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