Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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CNTN1Q12860 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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CNTN1Q12860 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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CNTN1Q12860 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CNTN1Q12860 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CNTN1Q12860 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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