Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMA1Q12791 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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