Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 COX14YML129C 213 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 GAL7YBR018C 1101 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 VPS3YDR495C 3036 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YDR061WYDR061W 1620 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 SMC6YLR383W 3345 nt2.9□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 STI1YOR027W 1770 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YDL187CYDL187C 330 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 RSM24YDR175C 960 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 NSA2YER126C 786 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 MIC19YFR011C 513 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YHR213WYHR213W 597 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YAR062WYAR062W 597 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 VPS63YLR261C 327 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 AIM32YML050W 936 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 ATP18YML081C-A 180 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 GYL1YMR192W 2163 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YOR364WYOR364W 369 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 DNL4YOR005C 2835 nt2.89□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 STE11YLR362W 2154 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 UTP14YML093W 2700 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 SGS1YMR190C 4344 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 MTC7YEL033W 420 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 VEL1YGL258W 621 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YGR228WYGR228W 345 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 SCEIQ0160 708 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YGR290WYGR290W 444 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 ENV10YLR065C 546 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 SWS2YNL081C 432 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 AIM4YBR194W 372 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 NCS2YNL119W 1482 nt2.88□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 SGM1YJR134C 2124 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 RIM13YMR154C 2184 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YDR220CYDR220C 294 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 LRP1YHR081W 555 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 BET4YJL031C 984 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 ACF4YJR083C 930 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 UBX4YMR067C 1251 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 RPS16AYMR143W 432 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 ATP19YOL077W-A 207 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YOR050CYOR050C 348 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 GEA1YJR031C 4227 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 TOM70YNL121C 1854 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 DIA2YOR080W 2199 nt2.87□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 BNI4YNL233W 2679 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YBR259WYBR259W 2067 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YCR108CYCR108C 192 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 RPB9YGL070C 369 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 VAR1Q0140 1197 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 ILM1YJR118C 612 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 ADI1YMR009W 540 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 RPL20AYMR242C 519 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 ACM1YPL267W 630 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 TIM12YBR091C 330 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 NTC20YBR188C 423 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 PHO91YNR013C 2685 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 VHR2YER064C 1518 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 UBP15YMR304W 3693 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 VPS64YDR200C 1815 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 FRE8YLR047C 2061 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 AFR1YDR085C 1863 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YEF3YLR249W 3135 nt2.86□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 SHS1YDL225W 1656 nt2.85□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 snR59snR59 78 nt2.85□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YLR076CYLR076C 423 nt2.85□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YNL150WYNL150W 408 nt2.85□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 RRD2YPL152W 1077 nt2.85□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 RPN3YER021W 1572 nt2.85□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 VPS30YPL120W 1674 nt2.85□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 SWR1YDR334W 4545 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YDR193WYDR193W 399 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YIL029CYIL029C 429 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YLR224WYLR224W 1110 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 CWC24YLR323C 780 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YMR181CYMR181C 465 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 YBR062CYBR062C 543 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 HBT1YDL223C 3141 nt2.84□□□□□ -1.95
LSP1Q12230 GAL80YML051W 1308 nt2.84□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PSK1YAL017W 4071 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 EXO84YBR102C 2262 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YER091C-AYER091C-A 222 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MTM1YGR257C 1101 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YJL169WYJL169W 369 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 CSE4YKL049C 690 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YLR257WYLR257W 966 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 PDP3YLR455W 915 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YNL203CYNL203C 612 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YPL142CYPL142C 318 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MRPL40YPL173W 894 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 CWH41YGL027C 2502 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 MSB1YOR188W 3414 nt2.83□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 TAF2YCR042C 4224 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 HFM1YGL251C 3564 nt2.82□□□□□ -1.96
LSP1Q12230 YNL193WYNL193W 1677 nt2.82□□□□□ -1.96
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