Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 PHD1YKL043W 1101 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 SDH3YKL141W 597 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RPL20AYMR242C 519 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YOR283WYOR283W 693 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YPR172WYPR172W 603 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 SPB1YCL054W 2526 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 FUS1YCL027W 1539 nt2.87□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 FUN30YAL019W 3396 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 TRZ1YKR079C 2517 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 TSC11YER093C 4293 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 BMH2YDR099W 822 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 IRC2YDR112W 309 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YDR193WYDR193W 399 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 PRS3YHL011C 963 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 APQ13YJL075C 417 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 UNG1YML021C 1080 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YMR144WYMR144W 1029 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YMR187CYMR187C 1296 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 MEI5YPL121C 669 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 VID24YBR105C 1089 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 ERG11YHR007C 1593 nt2.86□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 COG3YER157W 2406 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 HEH2YDR458C 1992 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 APC2YLR127C 2562 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YMR31YFR049W 372 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 MRM2YGL136C 963 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 MMS1YPR164W 4224 nt2.85□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 SRC1YML034W 2505 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 MET6YER091C 2304 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 CHZ1YER030W 462 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 STE18YJR086W 333 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 NYV1YLR093C 762 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RPL6AYML073C 531 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RIM9YMR063W 720 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 SWS2YNL081C 432 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 BUD21YOR078W 645 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 OST2YOR103C 393 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 YOR364WYOR364W 369 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RRD2YPL152W 1077 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 NPR1YNL183C 2373 nt2.84□□□□□ -1.95
NMD4Q12129 RRM3YHR031C 2172 nt2.84□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 DBP10YDL031W 2988 nt2.84□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 TAF2YCR042C 4224 nt2.84□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YIL169CYIL169C 2988 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 DAL5YJR152W 1632 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YDL016CYDL016C 303 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 CRD1YDL142C 852 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 FIN1YDR130C 876 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YIL029CYIL029C 429 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 RCN2YOR220W 798 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 RRG8YPR116W 834 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 TLC1TLC1 1301 nt2.83□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 CWC22YGR278W 1734 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 DYN2YDR424C 279 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 AST2YER101C 1293 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YJR141WYJR141W 1044 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YOL150CYOL150C 312 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YOR331CYOR331C 558 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 DUG2YBR281C 2637 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 MOT1YPL082C 5604 nt2.82□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 DYN1YKR054C 12279 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YDL009CYDL009C 324 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 PAU23YLR037C 375 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 ESF2YNR054C 951 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 PEP12YOR036W 867 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 POM152YMR129W 4014 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YME2YMR302C 2553 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 ECM21YBL101C 3354 nt2.81□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 RLF2YPR018W 1821 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 CCT7YJL111W 1653 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 PRE1YER012W 597 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YGL042CYGL042C 306 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 DFG10YIL049W 762 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YIL068W-AYIL068W-A 384 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 ILM1YJR118C 612 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 APC9YLR102C 798 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 HRI1YLR301W 735 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 SMA2YML066C 1110 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YNL179CYNL179C 438 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YPL034WYPL034W 498 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YPL068CYPL068C 882 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YPL216WYPL216W 3309 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 RSN1YMR266W 2862 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 KAP104YBR017C 2757 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 UBP14YBR058C 2346 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 ROG1YGL144C 2058 nt2.8□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 PSK2YOL045W 3306 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 MRH1YDR033W 963 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YER175W-AYER175W-A 165 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 ERV1YGR029W 570 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 RTS3YGR161C 792 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 GIC1YHR061C 945 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YIR020CYIR020C 303 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YLR012CYLR012C 300 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YLR252WYLR252W 306 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 52.7 ms