Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CGNL1Q0VF96 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CGNL1Q0VF96 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms