Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLFN5Q08AF3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLFN5Q08AF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms