RNAct
Search
Pairwise
Browse
Proteins
RNAs
Download
About
Search
Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
Predictions only
Length
590 aa
.
Download Table
Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
COX8
YLR395C
237 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
COQ10
YOL008W
624 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YBR032W
YBR032W
303 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
PDS5
YMR076C
3834 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
TIF4631
YGR162W
2859 nt
3.57
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
STU1
YBL034C
4542 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
DSF2
YBR007C
2211 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
GDI1
YER136W
1356 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YCR090C
YCR090C
549 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YDL009C
YDL009C
324 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
MRPL11
YDL202W
750 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
SMX2
YFL017W-A
234 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YFL065C
YFL065C
309 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
LIF1
YGL090W
1266 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
VEL1
YGL258W
621 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
ABM1
YJR108W
372 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YMR122W-A
YMR122W-A
255 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YBR209W
YBR209W
318 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YNR063W
YNR063W
1824 nt
3.56
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
DBF20
YPR111W
1695 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
ERB1
YMR049C
2424 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
RAD2
YGR258C
3096 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YJR098C
YJR098C
1971 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YGR073C
YGR073C
372 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
NBL1
YHR199C-A
222 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YHR214C-E
YHR214C-E
300 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YAL037W
YAL037W
804 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YKL083W
YKL083W
615 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
MRP8
YKL142W
660 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YKL156C-A
YKL156C-A
117 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YAR070C
YAR070C
300 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YPL142C
YPL142C
318 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YDR061W
YDR061W
1620 nt
3.55
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YRR1
YOR162C
2433 nt
3.54
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
BMS1
YPL217C
3552 nt
3.54
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
RTR2
YDR066C
591 nt
3.54
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
CWC24
YLR323C
780 nt
3.54
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
PIS1
YPR113W
663 nt
3.54
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
TRS120
YDR407C
3870 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YPR022C
YPR022C
3402 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YGR053C
YGR053C
852 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
MRPL31
YKL138C
396 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
MRPL38
YKL170W
417 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
COA4
YLR218C
453 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YLR434C
YLR434C
384 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YML009C-A
YML009C-A
327 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
YMR141C
YMR141C
309 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
ARR2
YPR200C
393 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
ARO1
YDR127W
4767 nt
3.53
□□□□□ -1.84
SGO1
Q08490
FLO9
YAL063C
3969 nt
3.53
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
PCK1
YKR097W
1650 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
SPA2
YLL021W
4401 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YDR338C
YDR338C
2088 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
FRQ1
YDR373W
573 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YER137W-A
YER137W-A
306 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
tV(CAC)D
tV(CAC)D
73 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
tV(CAC)H
tV(CAC)H
73 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YJL169W
YJL169W
369 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
ANB1
YJR047C
474 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YKL118W
YKL118W
312 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
ARV1
YLR242C
966 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
ADI1
YMR009W
540 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YMR316C-A
YMR316C-A
312 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YNL146C-A
YNL146C-A
195 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
RSC1
YGR056W
2787 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
TAF1
YGR274C
3201 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
MSD1
YPL104W
1977 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
RRN6
YBL014C
2685 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
GSC2
YGR032W
5688 nt
3.52
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
EMC1
YCL045C
2283 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
HBT1
YDL223C
3141 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
MRH1
YDR033W
963 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YDR149C
YDR149C
708 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
SMT3
YDR510W
306 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
RPL1B
YGL135W
654 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YGR051C
YGR051C
324 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
TCD1
YHR003C
1290 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YLR012C
YLR012C
300 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YMR031W-A
YMR031W-A
327 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YOR282W
YOR282W
321 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
RPL1A
YPL220W
654 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
NTC20
YBR188C
423 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
SLM2
YNL047C
1971 nt
3.51
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
CBP2
YHL038C
1893 nt
3.5
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
DFG10
YIL049W
762 nt
3.5
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
PHO81
YGR233C
3537 nt
3.5
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
SYT1
YPR095C
3681 nt
3.5
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
VAC8
YEL013W
1737 nt
3.5
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
SMC3
YJL074C
3693 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
GPI17
YDR434W
1605 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
BYE1
YKL005C
1785 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YBR259W
YBR259W
2067 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YDR442W
YDR442W
393 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YGR035C
YGR035C
351 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
MAM33
YIL070C
801 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
RPL15A
YLR029C
615 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
RMP1
YLR145W
606 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
YLR416C
YLR416C
399 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
SHH3
YMR118C
591 nt
3.49
□□□□□ -1.85
SGO1
Q08490
HHF1
YBR009C
312 nt
3.49
□□□□□ -1.85
First
Previous
55
Next
Last
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.2 ms