Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LOXL1Q08397 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LOXL1Q08397 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms