Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SRSF4Q08170 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms