Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms