Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNEQ04844 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNEQ04844 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms