Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC34.84■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
TOP2BQ02880 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC34.81■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
TOP2BQ02880 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
TOP2BQ02880 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms