Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLCB3Q01970 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PLCB3Q01970 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLCB3Q01970 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms