Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TMF1P82094 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TMF1P82094 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMF1P82094 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMF1P82094 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TMF1P82094 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TMF1P82094 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMF1P82094 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMF1P82094 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMF1P82094 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMF1P82094 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMF1P82094 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMF1P82094 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TMF1P82094 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TMF1P82094 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TMF1P82094 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms