Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ACTBP60709 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ACTBP60709 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTBP60709 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ACTBP60709 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ACTBP60709 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms