Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NLRP6P59044 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NLRP6P59044 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NLRP6P59044 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms