Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GYS2P54840 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GYS2P54840 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GYS2P54840 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GYS2P54840 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GYS2P54840 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GYS2P54840 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GYS2P54840 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GYS2P54840 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GYS2P54840 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GYS2P54840 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GYS2P54840 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GYS2P54840 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GYS2P54840 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GYS2P54840 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GYS2P54840 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GYS2P54840 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms