Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ATP12AP54707 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ATP12AP54707 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms