Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDK7P50613 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDK7P50613 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CDK7P50613 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CDK7P50613 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms