Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TNNI2P48788 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TNNI2P48788 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms