Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDKN1BP46527 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDKN1BP46527 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms