Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GPD2P43304 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GPD2P43304 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD2P43304 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD2P43304 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GPD2P43304 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms