Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PBX1P40424 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PBX1P40424 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PBX1P40424 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PBX1P40424 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PBX1P40424 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PBX1P40424 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PBX1P40424 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PBX1P40424 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms