Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCD1P33897 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ABCD1P33897 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms