Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ALDH4A1P30038 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ALDH4A1P30038 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms