Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
KDM5AP29375 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms