Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJB2P29033 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJB2P29033 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJB2P29033 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJB2P29033 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms