Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMGB2P26583 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMGB2P26583 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMGB2P26583 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms