Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCM3P25205 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCM3P25205 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCM3P25205 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
MCM3P25205 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCM3P25205 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCM3P25205 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MCM3P25205 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MCM3P25205 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCM3P25205 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCM3P25205 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
MCM3P25205 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MCM3P25205 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCM3P25205 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCM3P25205 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCM3P25205 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms