Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASTP20810 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASTP20810 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CASTP20810 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CASTP20810 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CASTP20810 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASTP20810 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASTP20810 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASTP20810 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASTP20810 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASTP20810 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASTP20810 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CASTP20810 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASTP20810 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms