Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTPRAP18433 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTPRAP18433 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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